La Comisión Nacional de Aéreas Protegidas (CONANP) viene realizando un fuerte trabajo en Baja California Sur en donde ha alcanzado metas de gran importancia como el lograr que más del 50% del territorio Sudcalifornio sea considerado Área Natural Protegida.

Las áreas naturales protegidas de BCS y todo el país son grandes espacios geográficos en los que legalmente se ha establecido algún régimen de protección para salvaguardar sus valores, principalmente naturales, aunque algunas veces también conjuntamente culturales o históricos, y que son administradas por una variedad de autoridades y organismos.